Posljednjih godina, nakon brojnih skandala s hranom, potrošači su pokazali da sve više paze na pitanja dobrobiti životinja . Kupnja organskih jaja znači paziti na zdravlje koka nesilica: njihova prehrana temelji se na biljnoj hrani i / ili hrani biološkog podrijetla, ne liječe se antibioticima, ne podvrgavaju se hormonalnim tretmanima, mogu se ogrebati na otvorenom i imati odgovarajuću površinu na raspolaganju.
S druge strane, Uredba EZ 834/2007 koja se odnosi na ekološku proizvodnju objašnjava: "ekološki uzgoj trebao bi udovoljavati strogim kriterijima za dobrobit životinja i (…) udovoljavati specifičnim potrebama životinja u ponašanju prema vrstama i upravljanju zdravlje životinja treba se temeljiti na prevenciji bolesti. S tim u vezi, posebnu pozornost treba obratiti na uvjete stanovanja, uzgojne prakse i gustoću stoke. "
Na organskim farmama pilića bolja dobrobit životinja dovodi do veće slobode ponašanja , manje stresa , manje iskorištavanja , pa bi se mogla dogoditi duža produktivna karijera.
Konačno, s higijensko-sanitarnog gledišta, neka istraživanja (Castellini C.; Mugnai C.; Dal Bosco A.; Palozzo M.; Scuota S.; 2004.) pokazala su da su organske kokoši opskrbljivale jaja s vrlo malim bakterijskim opterećenjima. (heterobakterije i mezofili) i odsutnost u ljusci Salmonella spp. karakteristike u skladu s potražnjom potrošača za zdravom i sigurnom hranom.
